La fumigación de la carga está diseñada para eliminar plagas portadoras de enfermedades, parásitos y otros insectos que puedan haber entrado en el buque o en el contenedor, como termitas, ácaros y ciertas polillas y escarabajos que proliferan en los embalajes de madera.
Muchos países latinoamericanos, como Chile, Argentina y Brasil, exigen la fumigación, el tratamiento térmico o la nebulización.
Algunos destinos, como Australia y Nueva Zelanda, están especialmente preocupados por la fauna y flora no autóctonas, como la chinche apestosa marrón (BMSB), que amenaza a su sector agrícola.
La fumigación es especialmente necesaria si los contenedores de transporte se cargan con unidades de embalaje unitarizadas hechas de madera, como cajas o palés. El proceso elimina el riesgo de contaminación y aumenta la seguridad.
Además, es un requisito de las normativas internacionales, como el Código Marítimo Internacional de Mercancías Peligrosas de la OMI y las leyes nacionales de la mayoría de los países.